فیلوسفر مکانی برای زندگی ریزموجودات است. باکتریها از جمله ساکنین فراوان فیلوسفر هستند که تعداد آنها تحت تاثیر گونه گیاه و نوع برگ قرار میگیرد. باکتریهای متعددی بصورت رورست در سطح اندامهای هوایی و بذور گیاه وجود داشته و در شرایط مساعد باعث بروز بیماری میشوند. در طی سالهای اخیر با بروز همهگیری بیماری بلایت باکتریائی پنبه در کشور و بخصوص استان گلستان در سطح وسیع نظریاتی مبنی بر وجود رورستی باکتری در سطح بذور پنبه مطرح گردید. به منظور شناسائی باکتریهای گرم منفی موجود در سطح بذور پنبه، ازبذور توصیه شده ارقام تجاری ساحل، ورامین، خرداد، بختگان و سپید بصورت تصادفی نمونه برداری شد. با قرار دادن بذور در داخل آب مقطر سترون و افزودن مقداری توئین 20 به عنوان ماده شوینده و قرار دادن محیط فوق در دمای اتاق به مدت یک ساعت به شستشوی بهتر باکتریهای موجود در سطح بذور کمک شد. سوسپانسیون فوق در روی محیط کشت مناسب مخطط گردید. در ادامه باکتریهای رشد کرده جداسازی، خالصسازی و بر اساس منابع معتبر باکتریولوژی شناسائی شدند. بر اساس نتایج حاصل گونههای Psuodomonas fluorescens، P. syringae، Pantoea annanas و Pectobacterium sp. شناسایی شدند. هیچ موردی از وجود باکتری Xanthomonas citri subsp.malvacearum به عنوان عامل بیماری بلایت باکتریایی بهصورت رورست در بذور پنبه به اثبات نرسید.